方濟常是有病在身，就好像他所呼吸的空氣一樣，方濟的整個生活常在病患之中。耶穌之神來到他的身上之前，他的疾病常是驚嚇著他，並目因著這些疾病的病情，常使他陷入極深且長期的憂鬱中。但是，就在他向天主聖神開放自己的那一刻起，他擁抱疾病，就好像擁抱著每天的十字架，不再感到沮喪了，只是對其可憐的軀體弟兄深感歉意並表示憐憫。因為軀體弟兄就像是一位忍受及肩負著許多痛苦的驢弟兄，只是偶而發出嘶叫的聲音。
在痛苦中，方濟更感覺到如此地接近耶穌。方濟並不是在自己懲罰自己，或是以痛苦為快樂；而是因為在患病中，讓他看見了軟弱中是最為強壯的時刻。在病患中，他幾乎常會感覺到軟弱，但在每一件事上，他都依賴聖神；他不依賴自己的力量，因為這樣做，會讓人失敗，只有耶穌才是方濟的唯一力量。貧窮本身就像是一種疾病，它會迫使你依賴天上的父親，而不會使你常在裝備自己。
方濟努力地讓自己愉快點，尤其在患病和痛苦時更是這樣。他如此行事，是怕弟兄們看到了，會以為他不只是想逃避痛苦，而且他們在痛苦時，會誤以為天主不再那麼愛著他們了。所以，方濟時常，且無論在什麼地方，他都會為弟兄們祈禱，求使他們也能經驗到使人得到淨化的疾病帶給人的甜蜜。因為疾病會讓他們從因著太過於依賴自己，或是不信賴天主所帶來的緊張或煩惱中獲得自由。
一天，方濟的眼疾所帶來的痛苦是如此的大，為了能夠讓痛苦減輕，他比平日更為緊湊地向耶穌祈禱。在祈禱中，他所得到的答覆是，要他立刻前往里耶地，在那裡有一位能夠幫助他的醫生。所以，方濟和良弟兄、安哲樂及路斐諾三人，在寒冷及潮濕的二月天，前往里耶地；這種潮濕的天氣，也實在讓方濟的眼疾更加痛苦難熬。刺骨的寒風，穿透了他襤褸的衣服，也滲透了他那嬌小微弱的身子。
前往里耶地的旅程，不像是前往羅馬、蘇丹、古比歐及拉維納山一樣，雖然路經那麼多塵土飛揚的路途及船海的旅程，但仍抱著期望及愉快的心情。這次的旅程雖然痛苦，但心中卻充滿著另一種喜樂，這是一趟走向加爾瓦略山的旅程，因為他知道有事在里耶地等著他。良弟兄早就告訴了方濟，這位醫生將會以炙熱手術來灼燒他的雙眼，那將是一種令人相當痛苦的手術，但無論發生什麼事，弟兄們都會在他的身邊。
良弟兄所說的，開始時真讓方濟嚇了一跳，但是，當他想到在十字架上的耶穌，他的心靈便開始喜悅了起來，因為他能分享弟兄們的苦難，即使那只是一點點的苦而已。所以這次的旅程，可以被補償並轉變成為喜樂。他們四人，雖是在寒冷和疲憊中，但是在耶穌內，他們藉著分享和關懷，卻都成為強壯的；進入里耶地，就好像是進入耶路撒冷城一樣。
方濟的加爾瓦略山正如同他自己所期待的一樣，這位醫生為方濟感到抱歉、痛苦及關懷；弟兄們則憂慮和緊張地一直在玩弄著繩索。當要為他的雙眼能夠從自私中獲得自由，他如昔日的精神一樣，他向火作了這樣的祈禱詞，而使醫生和弟兄們都感到驚訝：「我的火弟兄，為了那造了你的天主，也為了我過去對你的愛，而如今也仍愛著你，你要謙恭有禮，請溫和你的熱火，讓我能夠忍受它。」
這位醫生面頰流著汗，將燒了通紅的鐵放在方濟患病的眼上，雖然方濟自耳至眉毛處的地方，都被燒灼了，但是方濟卻一點也沒有感覺到痛苦。
弟兄們雖曾許下在他接受雙眼的炙熱手術時，不會離開房子，但是時候到時，他們卻逃出室外；他們因著自己所表現的懦弱，如今只有羞愧地又回到屋內；當方濟聽到他們走進屋裡時，他就開始給火弟兄唱著讚美詩，所有在里耶地的火，也跟著出現了生命，並且發出熊熊烈火的光明與喜樂。